Xiaomi Civi 3 在充电时发热严重可能是由多种原因引起的。以下是一些可能的解决方法：
1. 检查充电器和数据线：确保使用原装充电器和数据线，或者符合手机规格的充电器和数据线。低质量或不兼容的充电器可能导致充电过程中发热异常。
2. 避免同时使用手机：在充电时尽量避免同时使用手机进行高强度的任务，如玩游戏、观看视频等。这会增加手机的功耗，导致发热加剧。
3. 关闭不必要的功能：关闭手机上不必要的功能，如蓝牙、GPS、Wi-Fi 等，以减少电池消耗和发热。
4. 清理后台应用程序：关闭后台运行的不必要的应用程序，以释放系统资源，减少发热。
5. 避免高温环境：尽量避免在高温环境下充电，如阳光直射的地方或炎热的车内。高温环境会影响电池性能和充电效率，导致发热加重。
6. 更新系统和应用程序：确保手机系统和应用程序是最新版本，因为新版本可能会修复一些发热问题和优化充电性能。
7. 检查电池健康状况：如果手机使用时间较长，电池可能会出现老化或损坏，导致发热严重。

可以在手机设置中查看电池健康状况，或者联系小米客服进行咨询和检测。
8. 恢复出厂设置：如果以上方法都没有解决问题，可以尝试恢复出厂设置。请注意，在恢复出厂设置之前，请备份手机中的重要数据。

如果问题仍然存在，建议联系小米客服或前往小米授权维修点进行进一步的检测和维修。他们可以提供更专业的帮助和解决方案。