荣耀 Magic Vs 至臻版在充电时手机发热严重，可能是由以下原因导致的：
1. 环境温度过高：如果手机处于高温环境下，如阳光直射或炎热的天气中，充电时手机可能会发热。建议将手机移至凉爽通风的地方进行充电。
2. 充电器功率过大：使用功率过大的充电器可能会导致手机充电时发热。

建议使用原装充电器或符合手机规格的充电器进行充电。
3. 手机后台运行程序过多：如果手机后台运行程序过多，充电时手机可能会发热。建议关闭不必要的后台程序，以减少手机的负担。
4. 手机电池老化：如果手机电池老化，充电时手机可能会发热。建议更换手机电池，以确保手机的正常使用。

如果以上方法无法解决问题，建议联系荣耀客服或前往荣耀授权维修中心进行检修。